La historia comienza junto al primer recuerdo de Yuki, en el que se halla perdida durante una tormenta de nieve. Es atacada por un vampiro fuera de control, situación de la que es rescatada por otro vampiro, Kuran Kaname. Kaname, la lleva junto a Cross Kaien, que se convierte en su padre adoptivo, y más adelante, en el director de la Academia Privada Cross. Esa escuela tiene un sistema de clases nocturnas y diurnas, pero poca gente sabe que esa escuela de élite oculta un secreto: los alumnos de la Clase Nocturna son en realidad vampiros. El director y Kuran Kaname creen que es posible una convivencia pacífica de humanos y vampiros.
Zero, un chico procedente de una familia de cazadores de vampiros cuyos padres fueron asesinados por la vampiresa del eterno florecer, y de ello ya han pasado cuatro años, es uno de los pocos de la Clase Diurna que conocen el secreto y se ocupan de mantener el orden en la Academia. Zero odia a los vampiros más que a nada en el mundo por tanto está en contra del pacifismo del director y odia bastante a Kaname por ser de la misma clase que esa mujer, pero a su vez también oculta un gran secreto que lo tortura día a día.
A pesar de su profundo amor hacia Kuran Kaname, Yūki no es capaz de aceptarlo completamente ya que una parte de ella siempre ha amado a Zero, la persona que ha vivido junto a ella estos últimos cuatro años, pero quien no desea mostrar su naturaleza verdadera por temor a dañarla. A través de la historia se van revelando los profundos lazos que Yūki tiene hacia Zero y se da a conocer que no importa lo que pase ella, prefiere sacrificar su vida antes de verlo morir a él, por ello acepta gustosa en ayudarlo y no teme acercársele aun sabiendo que Kaname se disgusta y enfurece.
Personajes
Clase Diurna
Yuuki Cross : Cuando tenía cinco años fue atacada por un vampiro nivel e, pero Kuran Kaname la salvó de ser devorada. Ese es el primer recuerdo que tiene de su niñez. Diez años después, siendo hija adoptiva del director de la Academia Cross, Cross Kaien, es la guardiana de la Clase Diurna junto a Kiryü Zero. Los guardianes, evitan que los estudiantes de la Clase Diurna sean dañados por la Clase Nocturna (en la cual son todos vampiros dirigidos por Kuran Kaname) o que los alumnos normales descubran el secreto de la clase Nocurna. Zero está enamorado de ella pero yuuki no tiene claro del todo sus sentimientos hacia el ya que desde pequeña a estado enamorada de kaname.
Zero Kiryuu: La familia de Zero, eran cazadores de vampiros que fueron asesinados por la vampiresa de sangre pura Shizuka Hiou. El director de la academia lo adoptó también como a Yuuki. Allí junto a ella es el delegado de clase y, además, se acaba descubriendo que fue mordido por un vampiro pura sangre, Shizuka, por lo que se convirtió él también en un vampiro. Su problema, es que no puede asimilar las pastillas de sangre por lo que acaba mordiendo a Yuuki para ello. Él tiene un profundo odio a los vampiros, y aunque ame completamente a Yüki, le dice que la matará al igual que a Kaname por ser lo que más odia, una vampiresa pura sangre.
Ichiru Kiryuu: Es el hermano gemelo de Zero. De pequeño Ichiru quería y admiraba mucho a Zero, pero lo traiciono a él y a toda su familia porque se sentía menospreciado debido a su débil cuerpo y a su mala salud. Ichiru permaneció al lado de Shizuka hasta el momento de su muerte, y fue él quien la ayudo a matar a su familia, debido a una cuenta pendiente que esta tenia con sus padres. Poco después que Shizuka fuera asesinada por Kaname, muere pasificamente en los brazos de Zero luego de ser gravemente herido por redo, en sus ultimos momentos fue feliz de saber que aun era importante para su hermano a pesar de todo. le pide que beba su sangre como última voluntad para que de ese modo zero recupere la parte del poder de ambos que le pertenecia.
Yori Wakaba: Esta es la compañera de dormitorio de Yuki y mejor amiga desde secundaria. Yuuki suele llamarla Yori-chan. Ella es una de las pocas chicas que no le interesa la clase nocturna. Es muy observadora y descubre el secreto de la clase nocturna hacia el final del anime.
Clase Nocturna
Kaname Kuran: Vampiro de sangre pura, perdió a sus padres cuando era muy pequeño, aunque se cree que fue un suicidio, surge la teoría de un homicidio. Su pasión es jugar con un tablero de ajedrez poniendo y manipulando las piezas de manera que pueda proteger a Yuuki; salvó a Yūuki del ataque de otro vampiro cuando ella era pequeña. Él es presidente de la Clase Nocturna, temido y respetado por los otros estudiantes. Aunque frío con sus compañeros, es siempre amable y dulce con Yūki. quiere a Yūki como ella a él, pero está celoso y al mismo tiempo furioso con Zero por beber su sangre, acto que él no puede hacer por que ataría a Yuki a un destino de sufrimiento demasiado pronto. Perdona la vida de Zero a pesar de sus problemas porque sabe lo mucho que Yūki sufriría, además de que Zero es útil para cuidarla y también porque a éste no se lo permitiría tan fácilmente ya que aunque le hace caso es sólo una manera de tener a Yuki cerca. Yūki y Kaname realmente son amigos , aunque Kaname no revela todavía a Yūki que son realmente hermanos, a pesar de haber sido criados como tales y estar prometidos. Kaname manipula a todos los miembros de la Clase Nocturna solo para proteger a Yūki de su peor enemigo: Rido Kuran. De hecho, Kaname es el ancestro de los Kuran que fue despertado de su tumba por Rido. Por esta razón, él no puede matarle, ya que sería su "maestro", pero hay que tener en cuenta que a diferencia de la relación entre Shizuka y Zero donde éste último a pesar de no querer su cuerpo actuaba sólo, Kaname es un poderoso sangre pura manipulado por una jerarquía a la que puede dar vuelta a su merced.
Takuma Ichijō :Es el mejor amigo de Kaname, se conocen desde la infancia y es la mano derecha de Kaname, aunque no se muestra demasiado de él. Su abuelo pertenece al "Consejo de Ancianos". Posee como arma una Katana. En la segunda temporada, Takuma debe proteger a Rido, que está en el cuerpo de Shiki, aun en contra de Kaname, pero luego y recitando la siguiente frase "Te he traicionado como vampiro, pero no te traicionare como amigo", lucha contra su abuelo para ayudar a Kaname, luego de eso desaparece en el derrumbe que ocasiono Kaname, para poder derrotar al abuelo de Takuma, encontrándose sólo su espada. En el manga esto no pasó, apenas combatió con su tío, pero lo detuvo la pura sangre Sara, llevándolo consigo.
Hanabusa Aidou :Estudiante de la clase nocturna como así también es el ídolo para las chicas diurnas, ama comer dulces (puede llegar a comer como 4 platos) y le encanta que las chicas lo alaben. Es primo de Kain Akatsuki. Su familia es una de las más importantes en la sociedad de vampiros, ya que su padre es uno de los miembros del consejo de ancianos. Tiene el poder de manejar el hielo. Es uno de los más leales a Kaname Kuran, a quien lo quiere mucho e incluso haría todo lo estuviera en su alcance para ayudarlo. Es al paracer más guapo que Kaname Kuran aunque no se da mucho enfasis en eso, además de que es una persona sumamente inteligente y leal a su amigo Kaname.
Akatsuki Kain:Es el primo de Aidou. Un colaborador más de Kaname. Por lo general ignora lo que hace su primo, lo que lo lleva a meterse en problemas, que aun cuando intenta solucionarlos, lo que hace es empeorar la situación. Es más calmado que Aidou, incluso es muy serio a todo momento. Su apodo es “Wild” (“Salvaje”), aunque no tiene relación con su personalidad. Controla el fuego.
Senri Shiki:Es uno de los más jóvenes de la clase nocturna. Trabaja como modelo junto a Rima Tohya y a la vez son muy unidos, siempre se les ve juntos. Tiene una fuerte relación con Ichijou al igual que con Rima, por lo que juntos van a exterminar vampiros nivel E, cuando reciben la orden del senado (el abuelo de Ichijou forma parte del senado). Su padre es Rido Kuran, tío de Kaname, por lo que vendrían a ser primos, pero se dice que talvez Rido Kuran sea el padre de Kaname, y Yuki sea la única hija legítima. Su actitud es muy despreocupada, por lo que siempre es alentado por Ichijou. Su arma es un látigo que desarrolla con su sangre.
Rima Touya:Junto a Shiki es una de las más jóvenes de la clase y también trabaja como modelo. Es muy amiga de Shiki y por eso andan siempre juntos, su actitud es muy fría , casi nunca se le ve lejos de Senri Shiki al cuál le gusta cuidar y darle de comer chocolates. Su habilidad es el rayo.
Ruka Souen:Una de las chicas vampiresas. De actitud fría, siente atracción por Kaname, incluso ha permitido que le succione la sangre. Sin embargo no se sabe hasta qué punto estén relacionados, o que es lo que siente Kaname por ella. Es una de las más fieles y protectoras con Kaname. Siente desagrado por Yuki, pues no le gusta el interés que le tiene Kaname a ella.
Seiren:Es la guardaespaldas no oficial de Kaname, siempre dispuesta a colaborarle. Nada más Kaname pronuncia su nombre, ella aparece de la nada. Normalmente es la primera en defender a Kaname de cualquier peligro.
